Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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NCOA4Q13772 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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NCOA4Q13772 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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