Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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