Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAPQ12770 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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