Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01649 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01649 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01649 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01649 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01649 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01649 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01649 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01649 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01649 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01649 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01649 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01649 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01649 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01649 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01649 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01649 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01649 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01649 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01649 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01649 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01649 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01649 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01649 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01649 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01649 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01649 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P01649 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01649 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01649 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01649 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01649 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01649 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01649 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01649 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P01649 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01649 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P01649 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P01649 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01649 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01649 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01649 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P01649 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01649 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01649 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P01649 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01649 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01649 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01649 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01649 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01649 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01649 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01649 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01649 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01649 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01649 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01649 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01649 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01649 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01649 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01649 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01649 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01649 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01649 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01649 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01649 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01649 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01649 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01649 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01649 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01649 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01649 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01649 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01649 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01649 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01649 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01649 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01649 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01649 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01649 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P01649 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P01649 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P01649 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01649 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01649 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01649 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P01649 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P01649 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P01649 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P01649 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01649 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01649 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P01649 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P01649 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P01649 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P01649 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01649 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01649 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01649 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P01649 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms