Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F3O00716 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F3O00716 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F3O00716 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F3O00716 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F3O00716 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F3O00716 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F3O00716 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F3O00716 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F3O00716 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F3O00716 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F3O00716 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F3O00716 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F3O00716 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F3O00716 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F3O00716 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F3O00716 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F3O00716 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F3O00716 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F3O00716 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F3O00716 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F3O00716 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F3O00716 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F3O00716 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F3O00716 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F3O00716 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F3O00716 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F3O00716 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F3O00716 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F3O00716 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F3O00716 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F3O00716 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F3O00716 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F3O00716 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F3O00716 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F3O00716 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F3O00716 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F3O00716 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F3O00716 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F3O00716 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F3O00716 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F3O00716 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F3O00716 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F3O00716 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F3O00716 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F3O00716 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F3O00716 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F3O00716 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F3O00716 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F3O00716 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F3O00716 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F3O00716 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F3O00716 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F3O00716 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F3O00716 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F3O00716 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F3O00716 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F3O00716 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F3O00716 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F3O00716 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F3O00716 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F3O00716 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F3O00716 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F3O00716 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F3O00716 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F3O00716 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F3O00716 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F3O00716 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F3O00716 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F3O00716 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F3O00716 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F3O00716 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F3O00716 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F3O00716 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F3O00716 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F3O00716 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F3O00716 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F3O00716 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F3O00716 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F3O00716 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F3O00716 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F3O00716 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F3O00716 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F3O00716 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F3O00716 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F3O00716 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F3O00716 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F3O00716 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F3O00716 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F3O00716 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F3O00716 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F3O00716 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F3O00716 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F3O00716 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F3O00716 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F3O00716 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F3O00716 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F3O00716 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F3O00716 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F3O00716 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms