Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf109Q9NX04 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf109Q9NX04 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf109Q9NX04 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf109Q9NX04 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf109Q9NX04 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf109Q9NX04 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf109Q9NX04 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf109Q9NX04 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf109Q9NX04 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf109Q9NX04 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf109Q9NX04 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf109Q9NX04 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf109Q9NX04 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf109Q9NX04 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf109Q9NX04 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf109Q9NX04 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf109Q9NX04 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf109Q9NX04 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf109Q9NX04 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf109Q9NX04 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf109Q9NX04 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf109Q9NX04 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf109Q9NX04 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf109Q9NX04 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf109Q9NX04 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf109Q9NX04 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf109Q9NX04 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf109Q9NX04 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf109Q9NX04 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf109Q9NX04 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf109Q9NX04 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf109Q9NX04 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf109Q9NX04 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf109Q9NX04 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf109Q9NX04 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf109Q9NX04 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf109Q9NX04 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf109Q9NX04 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf109Q9NX04 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf109Q9NX04 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf109Q9NX04 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf109Q9NX04 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf109Q9NX04 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf109Q9NX04 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf109Q9NX04 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf109Q9NX04 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf109Q9NX04 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf109Q9NX04 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf109Q9NX04 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf109Q9NX04 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf109Q9NX04 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf109Q9NX04 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf109Q9NX04 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf109Q9NX04 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf109Q9NX04 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf109Q9NX04 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf109Q9NX04 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf109Q9NX04 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf109Q9NX04 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf109Q9NX04 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf109Q9NX04 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf109Q9NX04 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C1orf109Q9NX04 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C1orf109Q9NX04 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C1orf109Q9NX04 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C1orf109Q9NX04 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C1orf109Q9NX04 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf109Q9NX04 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf109Q9NX04 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf109Q9NX04 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf109Q9NX04 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf109Q9NX04 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf109Q9NX04 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf109Q9NX04 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf109Q9NX04 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf109Q9NX04 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf109Q9NX04 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf109Q9NX04 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf109Q9NX04 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf109Q9NX04 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf109Q9NX04 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf109Q9NX04 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf109Q9NX04 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf109Q9NX04 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf109Q9NX04 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf109Q9NX04 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf109Q9NX04 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf109Q9NX04 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf109Q9NX04 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf109Q9NX04 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf109Q9NX04 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf109Q9NX04 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf109Q9NX04 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf109Q9NX04 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf109Q9NX04 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf109Q9NX04 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf109Q9NX04 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf109Q9NX04 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf109Q9NX04 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms