Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms