Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Slit2-208ENSMUST00000173107 9960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Dysf-215ENSMUST00000204591 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Rel-201ENSMUST00000102864 7466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms