Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF4Q15306 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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