Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms