Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms