Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms