Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms