Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD9

ACTRT3, Actin-related protein T3, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT3Q9BYD9 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ACTRT3Q9BYD9 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ACTRT3Q9BYD9 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ACTRT3Q9BYD9 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ACTRT3Q9BYD9 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ACTRT3Q9BYD9 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ACTRT3Q9BYD9 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ACTRT3Q9BYD9 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ACTRT3Q9BYD9 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACTRT3Q9BYD9 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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