Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms