Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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TRAF1Q13077 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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TRAF1Q13077 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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TRAF1Q13077 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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TRAF1Q13077 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
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