Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MC1RQ01726 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms