Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MLH1P40692 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MLH1P40692 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MLH1P40692 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MLH1P40692 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MLH1P40692 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MLH1P40692 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MLH1P40692 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MLH1P40692 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MLH1P40692 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MLH1P40692 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MLH1P40692 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MLH1P40692 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MLH1P40692 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MLH1P40692 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MLH1P40692 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MLH1P40692 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MLH1P40692 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MLH1P40692 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MLH1P40692 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MLH1P40692 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MLH1P40692 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MLH1P40692 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MLH1P40692 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MLH1P40692 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MLH1P40692 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MLH1P40692 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MLH1P40692 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MLH1P40692 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MLH1P40692 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MLH1P40692 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MLH1P40692 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MLH1P40692 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MLH1P40692 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MLH1P40692 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MLH1P40692 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MLH1P40692 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MLH1P40692 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MLH1P40692 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MLH1P40692 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MLH1P40692 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MLH1P40692 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MLH1P40692 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MLH1P40692 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MLH1P40692 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MLH1P40692 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MLH1P40692 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MLH1P40692 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MLH1P40692 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MLH1P40692 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MLH1P40692 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MLH1P40692 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MLH1P40692 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MLH1P40692 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MLH1P40692 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MLH1P40692 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MLH1P40692 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MLH1P40692 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MLH1P40692 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MLH1P40692 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MLH1P40692 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MLH1P40692 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MLH1P40692 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MLH1P40692 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MLH1P40692 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MLH1P40692 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MLH1P40692 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MLH1P40692 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MLH1P40692 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MLH1P40692 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MLH1P40692 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MLH1P40692 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MLH1P40692 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MLH1P40692 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MLH1P40692 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MLH1P40692 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MLH1P40692 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MLH1P40692 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MLH1P40692 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MLH1P40692 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MLH1P40692 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MLH1P40692 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MLH1P40692 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MLH1P40692 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MLH1P40692 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MLH1P40692 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MLH1P40692 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MLH1P40692 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MLH1P40692 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MLH1P40692 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MLH1P40692 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MLH1P40692 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MLH1P40692 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MLH1P40692 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MLH1P40692 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MLH1P40692 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MLH1P40692 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MLH1P40692 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MLH1P40692 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MLH1P40692 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms