Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD27P26842 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD27P26842 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD27P26842 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD27P26842 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD27P26842 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD27P26842 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD27P26842 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD27P26842 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD27P26842 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD27P26842 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD27P26842 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD27P26842 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD27P26842 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD27P26842 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD27P26842 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD27P26842 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD27P26842 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD27P26842 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD27P26842 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD27P26842 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD27P26842 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD27P26842 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD27P26842 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD27P26842 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD27P26842 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD27P26842 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD27P26842 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD27P26842 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD27P26842 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD27P26842 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD27P26842 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD27P26842 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD27P26842 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD27P26842 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD27P26842 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD27P26842 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD27P26842 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD27P26842 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD27P26842 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD27P26842 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD27P26842 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD27P26842 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD27P26842 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD27P26842 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CD27P26842 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CD27P26842 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD27P26842 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD27P26842 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD27P26842 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD27P26842 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CD27P26842 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD27P26842 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD27P26842 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD27P26842 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD27P26842 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD27P26842 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD27P26842 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD27P26842 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD27P26842 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD27P26842 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD27P26842 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD27P26842 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD27P26842 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD27P26842 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CD27P26842 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD27P26842 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD27P26842 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD27P26842 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD27P26842 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD27P26842 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD27P26842 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD27P26842 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD27P26842 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD27P26842 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD27P26842 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD27P26842 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD27P26842 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD27P26842 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD27P26842 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD27P26842 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD27P26842 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD27P26842 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD27P26842 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD27P26842 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD27P26842 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD27P26842 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD27P26842 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD27P26842 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD27P26842 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD27P26842 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD27P26842 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD27P26842 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD27P26842 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD27P26842 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD27P26842 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD27P26842 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD27P26842 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD27P26842 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD27P26842 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.5 ms