Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms