Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX7Q9UNH6 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms