Protein–RNA interactions for Protein: Q99MX1

Usp26, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 26, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp26Q99MX1 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp26Q99MX1 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp26Q99MX1 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp26Q99MX1 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp26Q99MX1 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp26Q99MX1 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp26Q99MX1 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp26Q99MX1 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp26Q99MX1 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp26Q99MX1 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp26Q99MX1 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp26Q99MX1 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp26Q99MX1 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp26Q99MX1 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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Usp26Q99MX1 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp26Q99MX1 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp26Q99MX1 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp26Q99MX1 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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Usp26Q99MX1 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp26Q99MX1 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp26Q99MX1 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp26Q99MX1 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp26Q99MX1 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp26Q99MX1 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp26Q99MX1 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp26Q99MX1 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp26Q99MX1 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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Usp26Q99MX1 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp26Q99MX1 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp26Q99MX1 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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Usp26Q99MX1 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp26Q99MX1 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp26Q99MX1 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp26Q99MX1 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp26Q99MX1 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp26Q99MX1 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp26Q99MX1 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp26Q99MX1 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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Usp26Q99MX1 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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Usp26Q99MX1 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp26Q99MX1 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp26Q99MX1 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp26Q99MX1 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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Usp26Q99MX1 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp26Q99MX1 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp26Q99MX1 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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Usp26Q99MX1 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
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Usp26Q99MX1 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp26Q99MX1 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp26Q99MX1 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp26Q99MX1 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp26Q99MX1 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp26Q99MX1 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp26Q99MX1 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp26Q99MX1 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp26Q99MX1 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp26Q99MX1 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp26Q99MX1 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp26Q99MX1 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp26Q99MX1 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp26Q99MX1 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp26Q99MX1 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp26Q99MX1 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp26Q99MX1 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp26Q99MX1 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp26Q99MX1 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp26Q99MX1 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp26Q99MX1 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp26Q99MX1 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp26Q99MX1 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp26Q99MX1 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp26Q99MX1 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp26Q99MX1 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp26Q99MX1 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp26Q99MX1 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp26Q99MX1 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms