Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF549Q6P9A3 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms