Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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