Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms