Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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