Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AC087893.1-201ENST00000612818 664 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 MS4A3-201ENST00000278865 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AL591499.1-201ENST00000307155 1153 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 LINC01798-204ENST00000433396 682 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 LSMEM1-202ENST00000439068 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AL513283.1-201ENST00000441790 1087 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AC011632.1-203ENST00000522914 454 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AC097376.1-201ENST00000602907 997 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms