Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms