Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms