Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms