Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Cnih4Q9CX13 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Cnih4Q9CX13 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Cnih4Q9CX13 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Cnih4Q9CX13 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Cnih4Q9CX13 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Cnih4Q9CX13 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Cnih4Q9CX13 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Cnih4Q9CX13 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Cnih4Q9CX13 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Cnih4Q9CX13 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Cnih4Q9CX13 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Cnih4Q9CX13 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
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