Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWX9

SELENOM, Selenoprotein M, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOMQ8WWX9 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOMQ8WWX9 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms