Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms