Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Fam208bQ5DTT3 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Fam208bQ5DTT3 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam208bQ5DTT3 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11□□□□□ -0.65
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