Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms