Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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GEN1Q17RS7 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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GEN1Q17RS7 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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