Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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