Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 NUDT5-202ENST00000378937 919 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 PPIL3-202ENST00000392283 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 AC097493.2-201ENST00000468675 780 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 RSF1-IT1-201ENST00000528233 632 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
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MKRN4PQ13434 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 AP000941.1-201ENST00000530198 1388 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 AC023050.4-201ENST00000538830 1380 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
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MKRN4PQ13434 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
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MKRN4PQ13434 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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MKRN4PQ13434 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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MKRN4PQ13434 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 HIBCH-207ENST00000410045 854 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
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