Protein–RNA interactions for Protein: P49189

ALDH9A1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH9A1P49189 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALDH9A1P49189 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms