Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Hoxd10P28359 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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