Protein–RNA interactions for Protein: O95343

SIX3, Homeobox protein SIX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3O95343 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX3O95343 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX3O95343 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX3O95343 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX3O95343 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX3O95343 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX3O95343 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX3O95343 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX3O95343 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX3O95343 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX3O95343 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX3O95343 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX3O95343 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX3O95343 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX3O95343 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX3O95343 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX3O95343 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX3O95343 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX3O95343 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX3O95343 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX3O95343 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX3O95343 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX3O95343 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX3O95343 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX3O95343 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX3O95343 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX3O95343 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX3O95343 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX3O95343 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX3O95343 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX3O95343 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX3O95343 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX3O95343 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX3O95343 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX3O95343 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX3O95343 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX3O95343 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX3O95343 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX3O95343 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX3O95343 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX3O95343 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX3O95343 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX3O95343 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX3O95343 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX3O95343 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX3O95343 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX3O95343 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX3O95343 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX3O95343 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX3O95343 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX3O95343 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX3O95343 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX3O95343 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX3O95343 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX3O95343 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX3O95343 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX3O95343 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX3O95343 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX3O95343 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX3O95343 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX3O95343 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX3O95343 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX3O95343 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX3O95343 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX3O95343 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX3O95343 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX3O95343 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX3O95343 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX3O95343 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX3O95343 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX3O95343 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX3O95343 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX3O95343 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX3O95343 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX3O95343 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX3O95343 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX3O95343 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX3O95343 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX3O95343 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX3O95343 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX3O95343 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX3O95343 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX3O95343 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX3O95343 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX3O95343 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX3O95343 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX3O95343 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX3O95343 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX3O95343 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX3O95343 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX3O95343 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX3O95343 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX3O95343 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX3O95343 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX3O95343 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX3O95343 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX3O95343 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX3O95343 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX3O95343 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIX3O95343 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms