Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

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Length 426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms