Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCDC78A2IDD5 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms