Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A0U1RNP2 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms