Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms