Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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