Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
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TRAF1Q13077 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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TRAF1Q13077 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
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TRAF1Q13077 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRAF1Q13077 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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TRAF1Q13077 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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TRAF1Q13077 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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TRAF1Q13077 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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TRAF1Q13077 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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TRAF1Q13077 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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TRAF1Q13077 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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TRAF1Q13077 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
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