Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms