Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 AC009119.1-203ENST00000565064 577 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 AP005482.3-201ENST00000585877 720 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 Z98043.1-201ENST00000624123 339 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 LINC00969-278ENST00000626870 851 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 AC011525.2-202ENST00000590611 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 AL354892.3-201ENST00000586101 1630 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 LINC01047-201ENST00000415193 778 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 ZNF410-219ENST00000556797 1311 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB1Q02641 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms