Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms